SKSE ist eine Erweiterung der Script-Fähigkeiten der Engine. Mods wie SkyUI könnte man mit Bordmitteln in der Form gar nicht umsetzen.

Die besten Mods findet man über die Top-Listen des Nexus. Grössere und ältere Mods sind oft relativ sauber, weil viele Bug-Meldungen von Usern bereits behoben wurden und weil man als Bastler nicht in die Top-Listen kommt. Ich lese jeweils auch gerne die ersten Seiten des zugehörigen Threads, ob User oft über Crashes motzen und wie der Author darauf reagiert.
Jeder respektable Mod hat eine Read Me und eine Startseite, die einem über häufige Probleme und Inkompatibilitäten informieren, wer sie nicht von der ersten bis zurl letzten Zeile liest, ist selbst schuld. Da steht nämlich oft auch, welche Mods sich besonders als Erweiterung eignen, z.B. müssen Begleiter-und Pferde-Mods kompatibel sein.
Weniger ist mehr. Sich zuerst überlegen,was man unbedingt haben muss, z.B.bessere Pferde, ein brauchbares Menu und eine nette Rüstung. Nur einen Mod verwenden, der ein Thema betrifft, z.B. Begleiter. Zuerst SKSE und SkyUI als Minimum installieren, dann jeden Mod einzeln installieren, sich die Änderungen ansehen und erst dann neue Mods rein. Also erst weitere Mods installieren, wenn alles so funktioniert, wie es sollte.
Bevor man einen neuen Mod installiert, einen Save machen und wieder den laden, wenn man Probleme hatte und ihn deinstallieren musste. Skyrim ist eine Zicke, wenn es ums Deinstallieren von Mods geht, man kann damit Saves unbrauchbar machen.
Das Modding von Skyrim ist nicht völlig banal, man muss Erfahrungen sammeln, was funktioniert und was nicht. Da man ja Mods jeweils einzeln testet, ist es auch kein Problem, den wieder zu deinstallieren.